近日，国科温州研究院Eric Westhof院士联合广医-广州生物院联合生科院特聘教授、广州国家实验室研究员苗智超团队在Nature Methods上发表题为RNA-Puzzles Round V:Blind predictions of 23 RNA structures的文章，公布了RNA-Puzzles Round V（第五轮比赛）的结果，对来自全球18个团队的预测进行了大规模评估，涉及23个RNA结构，包括RNA元件、适配体、病毒元件、核酶和核开关等多种类型RNA结构。

 

RNA-Puzzles是一个2012年开始的国际合作项目，致力于评估RNA三维结构预测的最新进展。组织者在RNA三维结构数据发表之前将需要预测的序列发给全球的结构预测团队，在预测结束后各个团队反馈预测结果，等三维结构数据发表以后将预测结构与实验测定的结构进行比较，从而评估RNA三维结构预测的准确性，实现盲测。

本轮比赛(Round V)的预测结果显示，实现准确的RNA三维结构预测仍有难点需要克服。排名前四的团队中有三个团队也曾在CASP15蛋白质结构预测比赛的RNA赛道中名列前茅，这表明前几名的预测方法具有较好的稳定性。尤其是陈世杰教授团队和Rhiju Das团队，但不同预测方法在具体表现上差异不大。

本轮比赛的结果表明，虽然RNA结构预测领域取得了显著进展，但仍面临诸多挑战，未来RNA结构预测领域有望借助人工智能结合经典物理模拟方法和专家经验实现进一步突破。本论文提供的算法工具和测评数据都已经开源，公布在RNA-Puzzles官网（www.rnapuzzles.org）。该研究团队表示，欢迎全球对RNA结构模拟和结构解析有兴趣的同仁加入，参与RNA-Puzzles结构预测，也欢迎结构生物学家把解析的结构提供给RNA-Puzzles进行预测。

 

Eric Westhof院士和广医-广州生物院联合生科院特聘教授、广州国家实验室研究员苗智超为文章的共同通讯作者。研究得到广州国家实验室重点项目 (Grant No. 625 GZNL2023A01006, GZNL2024A01002, SRPG22-003, SRPG22-006, SRPG22-007, 626 HWYQ23-003, YW-YFYJ0102)、国家自然基金委项目 (32270707)和我院科研启动基金（WIUCASQD2024002）的共同资助。

Eric Westhof：国际著名生物化学与分子生物学家，法国斯特拉斯堡大学结构生物化学名誉教授、法国科学院院士、德国科学院院士、欧洲科学院院士、欧洲分子生物学组织（EMBO）成员。曾任法国国家研究中心（CNRS）分子与细胞生物学研究所所长、路易·巴斯德大学副校长、斯特拉斯堡大学副校长、法国生物化学与分子生物学会主席、国际RNA学会主席等。目前任RNA副主编、NAR、JMR和BBRC执行主编。Eric Westhof教授曾先后在比利时列日大学、德国雷根斯堡大学和美国威斯康星大学学习生物物理学和结构生物学。至今，已发表学术论文450余篇，总引用超过31500次，H-index超过95，出版专著4部，组织国际大型学术会议20余次，获12项国内外专业奖和个人终身成就奖，在核酸研究领域已取得非凡的成就、享有极高的国际声誉。

原文链接：https://www.nature.com/articles/s41592-024-02543-9。