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报告题目:假单胞菌中表观遗传、RNA结构动力学和调控网络研究

报告时间:2024年12月5日(周四) 上午9:30

报告地点:3号楼307会议室

报告人:黄佳黛 香港城市大学

邀请人:吴敏 研究员

 
简介:黄佳黛,香港城市大学博士后研究员。2020-2024香港城市大学与康奈尔大学联合培养博士。研究方向主要聚焦为植物病原菌Pseudomonas syringae 和人类病原菌Pseudomonas aeruginosa的毒力调控及DNA表观遗传学。其研究重点包括P. aeruginosa的临床菌株,探讨其遗传多样性、噬菌体、防御系统和宏基因组学。相关研究发表在Cell Reports, mBio以及eLife等主流杂志。

摘要:P. syringae和P. aeruginosa是假单胞菌常见致病菌,给农业生产及临床研究带来风险和挑战。在P. syringae中,毒力主要通过III型分泌系统(T3SS)、生物膜形成及RNA结构变化介导。利用DMS测序,研究发现毒力诱导培养基(MM)中的mRNA结构变化会影响翻译效率及毒力。RNA结合蛋白Hfq调控RNA结构及毒力基因表达,且RpoS和CysB在MM条件下共同调控Hfq表达。此外,研究表明HsdMSR系统的DNA甲基化影响转录及毒力通路。针对P. aeruginosa,研究集中于其转录调控网络(TRN),这一系统控制生物膜形成、运动性及抗生素耐药性。通过ChIP-seq分析,绘制了PAO1菌株中172个转录因子的结合位点,揭示了调控毒力的复杂性。这些数据整合到一个网络数据库中,为后续研究提供支持。该研究从RNA结构、DNA甲基化及转录调控多个层面提供了综合分析,深化了对细菌致病机制的理解,并为抗菌策略开发提供了新方向。

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