报告题目：基于深度学习和分子指纹的化合物hERG毒性预测研究
报告时间：2023年4月20日（周四） 下午15:00-17:00
报告地点：3号楼309会议室
报告人：赵琪 教授
邀请人：帅建伟 研究员
简历：赵琪，辽宁科技大学计算机与软件工程学院教授，博士生导师，理学博士，厦门大学博士后。美国密歇根州立大学数学系联合培养博士，以色列特拉维夫大学、意大利国际理论物理中心及爱尔兰都柏林大学爱尔兰系统生物学研究所访问学者。研究方向：生物信息学，智能计算方法与大数据分析，生物医药大数据的统计挖掘等。发表论文79篇，其中第一或通讯作者SCI检索论文53篇。辽宁省百千万人才工程万人层次，沈阳市拔尖人才，中国计算机学会高级会员。担任十余个SCI期刊的副主编或编委。
摘要：人类果蝇相关基因human ether-a-go-go-related gene（hERG）通道被小分子阻断是药物开发过程中的一大问题。本文提出了一种基于分子指纹和图注意力机制的深度学习模型来预测小分子化合物的hERG通道阻断活性，名为DMFGAM。5折交叉验证结果表明，DMFGAM在我们自己构建的数据集上实现了0.894的AUC和0.817的ACC，这比现有的四种主流的计算方法都要好。同时，我们的模型在三个外部验证集上也获得不错的结果，证明了我们方法的可靠性和鲁棒性。
